Slovník | Vyhledávání | Mapa webu
 
Analýza genomických a proteomických datAnalýza sekvencí DNA Genetické databáze


Logo Matematická biologie

Genetické databáze

Genetická informace je uchovávána ve třech lokálních verzích databází: GenBanka v Severní Americe na adrese http://www.ncbi.nlm.nih.gov, EMBLbanka (neboli European Nucleotide Archive, ENA) v Evropě na adrese http://www.ebi.ac.uk a DDBJ (DNA Data Bank of Japan) v Asii na adrese http://www.ddbj.nig.ac.jp. Jejich spolupráci zastřešuje International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC, http://www.insdc.org). Všechny údaje v genetických databázích jsou veřejně dostupné a denně aktualizované mezi databázemi.

Primární údaje do databází vkládají uživatelé, kteří jsou zároveň odpovědní za jejich správnost. Tyto údaje jsou nejčastěji ve formě DNA sekvencí, které obsahují základní informace o původu sekvence a jejím obsahu. Z vložené sekvence (Anotace) se dál údaje používají k propojení na související databáze, např. na proteinovou databázi, taxonomickou databázi nebo databázi referenčních sekvencí. Propojení zabezpečí správa databází, uživatel vkládá sekvenci.

 
vytvořil Institut biostatistiky a analýz Lékařské fakulty Masarykovy univerzity