Autokorelace MCMC

Jelikož změny hypotézy jsou v každé generaci MCMC relativně malé, věrohodnost řešení v následující generaci je závislá na předchozí hodnotě. V případě, že je nový strom zamítnut, tak dokonce vzorkujeme opakovaně to samé řešení. Pro následnou sumarizaci je ale potřebné, aby v posteriorní vzorce byly nezávislé stromy. Řešením je sporadické ukládání výsledků každou stou až každou tisící generaci. Pokud mezi uloženými výsledky proběhlo dostatečné množství generací, můžeme předpokládat, že uložené výsledky budou na sobě dostatečně nezávislé.

mcmcp samplefreq=1000;