Umělá inteligence |
Vícerozměrné metody pro analýzu a klasifikaci dat |
Statistické modelování |
Teorie a praxe jádrového vyhlazování |
Regresní modelování |
Statistické hodnocení biodiverzity |
Úvod do analýzy diverzity |
Výstupy z výukové jednotky |
Definice biodiverzity |
Kvalitativní a kvantitativní komponenta biodiverzity |
α, β, γ diverzita |
Biodiverzita jako cílový parametr v hodnocení ekologických rizik |
Data pro analýzu biodiverzity |
Biodiverzita jako integrující ukazatel stavu biologických společenstev |
Produkce a velikost společenstev |
Struktura a typ společenstev |
Koncept chápání biodiverzity v ekologických studiích |
Vývoj a stabilita společenstev |
Pozice ukazatelů biologických společenstev v celkovém hodnocení vlivu stresoru |
Současný vývoj metod v hodnocení biodiverzity |
Software pro analýzu biodiverzity |
Standardní komerční statistické softwary |
PAST |
Power niche 1.0 |
EstimateS |
MVSP |
PC-ORD |
R a jeho knihovny specializované na analýzu biodiverzity |
Literatura |
Výstupy z výukové jednotky |
Vzorkování biodiverzity |
Ukládání dat biodiverzity |
Příprava a čištění dat pomocí nástrojů MS Excel |
Literatura |
Vizualizace biodiverzity |
Výstupy z výukové jednotky |
Vizualizace biodiverzity |
Rozložení a transformace dat při analýze biodiverzity |
Literatura |
Diverzitní a biotické indexy |
Výstupy z výukové jednotky |
Principy a cíle výpočtu indexů diverzity |
Indexy založené na početnosti druhů |
Indexy založené na poměru početnosti druhů |
Q statistika |
Velikost vzorku a indexy biodiverzity – rarefakce |
Vztahy mezi indexy biodiverzity |
Odhad intervalů spolehlivosti a statistické testování biodiverzitních indexů |
Biotické indexy |
Literatura |
Modely druhové abundance |
Výstupy z výukové jednotky |
Modely druhové abundance |
Stochastické modely |
Simulační, na niku orientované modely |
Literatura |
Stochastické modely druhové abundance |
Výstupy z výukové jednotky |
Geometrická řada |
Logaritmická řada (série) |
Log-normální rozložení |
Zlomená hůlka (broken stick) |
Zipfovy-Mandelbrotovy modely |
Literatura |
Na niku orientované modely druhové abundance |
Výstupy z výukové jednotky |
Geometrická řada |
Složený model (composite model) |
Náhodné roztřídění (random assortment) |
Odmítnutí dominance (dominance decay) |
Zlomená hůlka (broken stick) alias MacArthurova frakcionace |
Sugiharův model postupného dělení (Sugihara sequential breakage model) |
Náhodná frakcionace (random fraction) |
Předpoklad dominance (dominance preemption) |
Literatura |
Metody hodnocení β-diverzity |
Výstupy z výukové jednotky |
Beta biodiverzita a vícerozměrná analýza biodiverzity |
Problém dvojité nepřítomnosti(double-zero problem) |
Koeficienty podobnosti pro data o biodiverzitě (β biodiverzita) |
Vícerozměrné analýzy s přímou vazbou na analýzu biodiverzity |
Interakce taxonů a struktura společenstev v hodnocení diverzity |
Výstupy z výukové jednotky |
Hodnocení kompetice, agregace a šíře niky |
Možnosti frakcionace biologických společenstev a následná analýza biodiverzity získaných slož |
Výpočetní nástroje |
Rozdílný vliv prostředí na různé složky společenstva |
Frakcionace společenstva – taxonomická, funkční aj. |
Identifikace složek společenstva s konzistentní reakcí na faktory prostředí |
Využití markovských řetězců v analýze biodiverzity |
Literatura |
Standardní komerční statistické softwary
Biodiverzitu lze analyzovat celou řadou statistických softwarů, od standardních komerčních statistických balíků až po nejrůznější volně šiřitelné nástroje.
Běžné komerční software (SPSS – www.spss.com, Statistica – www.statsoft.com, SAS www.sas.com, Stata – www.stata.com, S-PLUS - spotfire.tibco.com, CANOCO) umožňují standardní statistické výpočty (popisná statistika, testy, modelování), ale s vyjímkou vícerozměrné analýzy dat (asymetrické koeficienty podobnosti, korespondenční analýza, nemetrické mnohorozměrné škálování) nedisponují specializovanými biodiverzitními výpočty (indexy diverzity, modely profilů abundance). Pro biodiverzitní výpočty jsou pak vhodnější specializované nástroje představené v následujících kapitolách
