Umělá inteligence |
Vícerozměrné metody pro analýzu a klasifikaci dat |
Statistické modelování |
Teorie a praxe jádrového vyhlazování |
Regresní modelování |
Statistické hodnocení biodiverzity |
Úvod do analýzy diverzity |
Výstupy z výukové jednotky |
Definice biodiverzity |
Kvalitativní a kvantitativní komponenta biodiverzity |
α, β, γ diverzita |
Biodiverzita jako cílový parametr v hodnocení ekologických rizik |
Data pro analýzu biodiverzity |
Biodiverzita jako integrující ukazatel stavu biologických společenstev |
Produkce a velikost společenstev |
Struktura a typ společenstev |
Koncept chápání biodiverzity v ekologických studiích |
Vývoj a stabilita společenstev |
Pozice ukazatelů biologických společenstev v celkovém hodnocení vlivu stresoru |
Současný vývoj metod v hodnocení biodiverzity |
Software pro analýzu biodiverzity |
Standardní komerční statistické softwary |
PAST |
Power niche 1.0 |
EstimateS |
MVSP |
PC-ORD |
R a jeho knihovny specializované na analýzu biodiverzity |
Literatura |
Výstupy z výukové jednotky |
Vzorkování biodiverzity |
Ukládání dat biodiverzity |
Příprava a čištění dat pomocí nástrojů MS Excel |
Literatura |
Vizualizace biodiverzity |
Výstupy z výukové jednotky |
Vizualizace biodiverzity |
Rozložení a transformace dat při analýze biodiverzity |
Literatura |
Diverzitní a biotické indexy |
Výstupy z výukové jednotky |
Principy a cíle výpočtu indexů diverzity |
Indexy založené na početnosti druhů |
Indexy založené na poměru početnosti druhů |
Q statistika |
Velikost vzorku a indexy biodiverzity – rarefakce |
Vztahy mezi indexy biodiverzity |
Odhad intervalů spolehlivosti a statistické testování biodiverzitních indexů |
Biotické indexy |
Literatura |
Modely druhové abundance |
Výstupy z výukové jednotky |
Modely druhové abundance |
Stochastické modely |
Simulační, na niku orientované modely |
Literatura |
Stochastické modely druhové abundance |
Výstupy z výukové jednotky |
Geometrická řada |
Logaritmická řada (série) |
Log-normální rozložení |
Zlomená hůlka (broken stick) |
Zipfovy-Mandelbrotovy modely |
Literatura |
Na niku orientované modely druhové abundance |
Výstupy z výukové jednotky |
Geometrická řada |
Složený model (composite model) |
Náhodné roztřídění (random assortment) |
Odmítnutí dominance (dominance decay) |
Zlomená hůlka (broken stick) alias MacArthurova frakcionace |
Sugiharův model postupného dělení (Sugihara sequential breakage model) |
Náhodná frakcionace (random fraction) |
Předpoklad dominance (dominance preemption) |
Literatura |
Metody hodnocení β-diverzity |
Výstupy z výukové jednotky |
Beta biodiverzita a vícerozměrná analýza biodiverzity |
Problém dvojité nepřítomnosti(double-zero problem) |
Koeficienty podobnosti pro data o biodiverzitě (β biodiverzita) |
Vícerozměrné analýzy s přímou vazbou na analýzu biodiverzity |
Interakce taxonů a struktura společenstev v hodnocení diverzity |
Výstupy z výukové jednotky |
Hodnocení kompetice, agregace a šíře niky |
Možnosti frakcionace biologických společenstev a následná analýza biodiverzity získaných slož |
Výpočetní nástroje |
Rozdílný vliv prostředí na různé složky společenstva |
Frakcionace společenstva – taxonomická, funkční aj. |
Identifikace složek společenstva s konzistentní reakcí na faktory prostředí |
Využití markovských řetězců v analýze biodiverzity |
Literatura |
Logaritmická řada (série)
Logaritmické řady se stejně jako geometrické řady hodí pro popis situací, kdy ekologii společenstva dominuje jeden nebo málo faktorů. Avšak pokles abundance mezi jednotlivými druhy (tedy dominance) je pomalejší než v případě geometrické řady. Od jejich rozložení je odvozen index diverzity , což je vlastně koeficient příslušné funkce. Výpočet probíhá podle vztahu:
|
|
(1) |
kde je počet druhů v kategorii s
jedinci a
je iteračně odhadováno ze vztahu
|
|
(2) |
kde je celkový počet druhů,
je celkový počet jedinců a
index diverzity (může sloužit též jako index diverzity) a jeho variabilita je:
|
(3) |
