Výstupy z výukové jednotky

Student:

• zná specifické, na technologii závislé zdroje nežádoucího technického šumu v datech oligonukleotidových mikročipů,
• pomocí grafických nástrojů a statistických metod identifikuje přítomnost a zdroj tohoto šumu v datech,   
• aplikuje statistické metody používané pro odstranění nežádoucího šumu,   
• provede transformaci zdrojových dat (normalizaci),   
• standardizuje měření mezi jednotlivými datovými soubory,  
• pracuje v SW prostředí R a Bioconductor pro úpravy a analýzu genomických a proteomických dat,
• aplikuje vybrané balíky R a Bioconductor a jejich funkce pro úpravu dat,
• vytvoří finální datový soubor pro další analýzy.