Slovník | Vyhledávání | Mapa webu
 
Analýza genomických a proteomických datAnalýza genomických a proteomických dat Současné výzvy a technologie genomiky a proteomiky Moderní technologie analýzy genomu a proteomu a jejich datové výstupy Shrnutí

Logo Matematická biologie

Shrnutí

Nakonec si pro orientaci shrňme jednotlivé technologie podle jejich použití:

  • Analýza genomu (od nukleotidových sekvencí po plně anotovaný genom)
    • Analýza struktury genomu – DNA sekvenace, Chip-seq, RNA-seq
    • Analýza genové exprese – Microarrays, SAGE, MPSS, Expressed sequence tags (ESTs)
    • Porovnávací genomika – aCGH arraye, SNP polymorfismy,  mikročipy alternativního sestřihu, fingerprinting
    • Regulace genomu – CHip-on-chip
  • Analýza proteomu (od hmostnostních spekter – přes komplexní struktury proteinových shluků  - po analýzu proteinové funkce)
    • Analýza struktury: Proteinová sekvenace
    • Analýza exprese: Hmotnostní spektrometrie, Proteinové mikročipy, 2D gelová elektroforéza
    • Analýza funkce: Modelování makromolekulárních systémů – odvozování vlastností z atomových interakcí
  • Modelování komplexních systémů – proteinové interakce, buněčné dráhy, regulační a metabolické sítě...

 

 
vytvořil Institut biostatistiky a analýz Lékařské fakulty Masarykovy univerzity