
Příklady k procvičení
1. Co je hlavním principem mikročipu?
Hlavním principem je fixace označených molekul na pevný povrch do tisíců drobných oblastí nazývaných spoty.
2. Na co slouží hmotnostní spektrometrie a jaký je její princip?
Hmotnostní spektrometrie se používá pro měření molekulární hmotnosti vzorku. V proteomice je používána pro analýzu proteinů, peptidů a oligonukleotidů. Princip je založen na oddělování ionizovaných molekul peptidů na základě hodnot poměru jejich hmotnosti k náboji (mass-to-charge (m/z) ratio)
3. K čemu slouží referenční vzorek?
Jsou nejdůležitější nástroj k odstranění šumu a kalibraci naměřených hodnot vzorku.
4. V této kapitole jsme si definovali pojmy základní datová matice a finální datová matice - jaký je mezi nimi rozdíl?
Základní datová matice je kvantifikovaný výstup jednoho měření obsahující informace náležící danému přístroji a kvantifikované hodnoty měřeného vzorku (vzorků) a někdy také indikátorové hodnoty kvality měření. Finální datová matice vzniká extrakcí informace o kvantitě sledovaných molekul z několika základních datových matic představujících různé vzorky a je formátu Ynxp, kde n je počet vzorků a p počet sledovaných molekul (genů, proteinů).