Analýza a management dat pro zdravotnické obory, Analýza klinických dat |
Aplikovaná analýza přežití |
Základní pojmy analýzy přežití |
Biostatistika pro matematickou biologii |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Cenzorování |
Vliv cenzorování na hodnocení přežití |
Literatura |
Hlavní charakteristiky v analýze přežití |
Výstupy z výukové jednotky |
Funkce přežití |
Výpočetní vztahy |
Další charakteristiky přežití |
Úloha k procvičení |
Literatura |
Neparametrické odhady |
Parametrické a neparametrické odhady |
Kaplanův-Meierův odhad funkce přežití |
Odhad funkce přežití metodou úmrtnostních tabulek |
Nelsonův-Aalenův odhad kumulativní rizikové funkce |
Breslowův odhad funkce přežití |
Úlohy k procvičení |
Literatura |
Parametrické odhady |
Výstupy z výukové jednotky |
Hlavní rozdělení pravděpodobnosti v analýze přežití |
Metody pro srovnání odhadů přežití |
Exponenciální rozdělení |
Weibullovo rozdělení |
Logaritmicko-normální rozdělení |
Logaritmicko-logistické rozdělení |
Metoda maximální věrohodnosti |
Ověření předpokladu exponenciálního a Weibullova rozdělení |
Literatura |
Výstupy z výukové jednotky |
Testování hypotéz v analýze přežití |
Mantelův-Haenszelův log-rank test |
Neparametrické alternativy log-rank testu |
Srovnání přežití tří a více skupin subjektů |
Literatura |
Relativní přežití |
Výstupy z výukové jednotky |
Přežití související s daným onemocněním |
Výpočet relativního přežití |
Věková standardizace |
Literatura |
Regresní modely v analýze přežití |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Modely proporcionálních rizik |
Modely zrychleného času (Accelerated Failure Time, AFT) |
Literatura |
Coxův model proporcionálních rizik I |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Odhad regresních koeficientů Coxova modelu |
Testy o regresních koeficientech |
Breslowův odhad základní rizikové funkce |
Literatura |
Coxův model proporcionálních rizik II |
Výstupy z výukové jednotky |
Sestavení modelu |
Výběr vysvětlujících proměnných do modelu |
Stratifikovaný Coxův model |
Coxův model s časově závislou vysvětlující proměnnou |
Náhodné efekty v Coxově modelu |
Literatura |
Nástroje regresní diagnostiky |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Rezidua modelu |
Ověření předpokladu proporcionality rizik |
Hodnocení vhodnosti modelu |
Literatura |
Modely s podílem vyléčených pacientů |
Literatura
Použitá literatura:
- Sposto, R. Cure model analysis in cancer: an application to data from the children’s cancer group. 2002, Statistics in Medicine, 21: 293-312.
- Lambert, P. C., Thompson, J., Weston, C. L., Dickman, P. W. Estimating and modelling the cure fraction in population-based cancer survival analysis. 2007, Biostatistics, 8: 576-594.
Doporučená literatura:
- Andersson, T. M.-L., Dickman, P. W., Eloranta, S., Lambert, P. C. Estimating and modelling cure in population-based cancer studies within the framework of flexible parametric survival models. 2011, BMC Medical Research Methodology, 11: 96.
