Analýza a management dat pro zdravotnické obory, Analýza klinických dat |
Aplikovaná analýza přežití |
Základní pojmy analýzy přežití |
Biostatistika pro matematickou biologii |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Cenzorování |
Vliv cenzorování na hodnocení přežití |
Literatura |
Hlavní charakteristiky v analýze přežití |
Výstupy z výukové jednotky |
Funkce přežití |
Výpočetní vztahy |
Další charakteristiky přežití |
Úloha k procvičení |
Literatura |
Neparametrické odhady |
Parametrické a neparametrické odhady |
Kaplanův-Meierův odhad funkce přežití |
Odhad funkce přežití metodou úmrtnostních tabulek |
Nelsonův-Aalenův odhad kumulativní rizikové funkce |
Breslowův odhad funkce přežití |
Úlohy k procvičení |
Literatura |
Parametrické odhady |
Výstupy z výukové jednotky |
Hlavní rozdělení pravděpodobnosti v analýze přežití |
Metody pro srovnání odhadů přežití |
Exponenciální rozdělení |
Weibullovo rozdělení |
Logaritmicko-normální rozdělení |
Logaritmicko-logistické rozdělení |
Metoda maximální věrohodnosti |
Ověření předpokladu exponenciálního a Weibullova rozdělení |
Literatura |
Výstupy z výukové jednotky |
Testování hypotéz v analýze přežití |
Mantelův-Haenszelův log-rank test |
Neparametrické alternativy log-rank testu |
Srovnání přežití tří a více skupin subjektů |
Literatura |
Relativní přežití |
Výstupy z výukové jednotky |
Přežití související s daným onemocněním |
Výpočet relativního přežití |
Věková standardizace |
Literatura |
Regresní modely v analýze přežití |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Modely proporcionálních rizik |
Modely zrychleného času (Accelerated Failure Time, AFT) |
Literatura |
Coxův model proporcionálních rizik I |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Odhad regresních koeficientů Coxova modelu |
Testy o regresních koeficientech |
Breslowův odhad základní rizikové funkce |
Literatura |
Coxův model proporcionálních rizik II |
Výstupy z výukové jednotky |
Sestavení modelu |
Výběr vysvětlujících proměnných do modelu |
Stratifikovaný Coxův model |
Coxův model s časově závislou vysvětlující proměnnou |
Náhodné efekty v Coxově modelu |
Literatura |
Nástroje regresní diagnostiky |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Rezidua modelu |
Ověření předpokladu proporcionality rizik |
Hodnocení vhodnosti modelu |
Literatura |
Modely s podílem vyléčených pacientů |
Coxův model proporcionálních rizik II
V předchozí kapitole byl definován Coxův model proporcionálních rizik a byla uvedena základní metodika týkající se odhadu a testování regresních koeficientů. Tato kapitola doplňuje předchozí o zajímavá témata, která jdou nad rámec standardního Coxova modelu, ale jsou důležitá z hlediska jeho praktického použití na reálných datech. V kapitole je zmíněno sestavování modelu, postupy pro výběr vysvětlujících proměnných a metodická rozšíření Coxova modelu umožňující pracovat i s daty, která nesplňují jeho základní předpoklady.
