Analýza a management dat pro zdravotnické obory, Analýza klinických dat |
Aplikovaná analýza přežití |
Základní pojmy analýzy přežití |
Biostatistika pro matematickou biologii |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Cenzorování |
Vliv cenzorování na hodnocení přežití |
Literatura |
Hlavní charakteristiky v analýze přežití |
Výstupy z výukové jednotky |
Funkce přežití |
Výpočetní vztahy |
Další charakteristiky přežití |
Úloha k procvičení |
Literatura |
Neparametrické odhady |
Parametrické a neparametrické odhady |
Kaplanův-Meierův odhad funkce přežití |
Odhad funkce přežití metodou úmrtnostních tabulek |
Nelsonův-Aalenův odhad kumulativní rizikové funkce |
Breslowův odhad funkce přežití |
Úlohy k procvičení |
Literatura |
Parametrické odhady |
Výstupy z výukové jednotky |
Hlavní rozdělení pravděpodobnosti v analýze přežití |
Metody pro srovnání odhadů přežití |
Exponenciální rozdělení |
Weibullovo rozdělení |
Logaritmicko-normální rozdělení |
Logaritmicko-logistické rozdělení |
Metoda maximální věrohodnosti |
Ověření předpokladu exponenciálního a Weibullova rozdělení |
Literatura |
Výstupy z výukové jednotky |
Testování hypotéz v analýze přežití |
Mantelův-Haenszelův log-rank test |
Neparametrické alternativy log-rank testu |
Srovnání přežití tří a více skupin subjektů |
Literatura |
Relativní přežití |
Výstupy z výukové jednotky |
Přežití související s daným onemocněním |
Výpočet relativního přežití |
Věková standardizace |
Literatura |
Regresní modely v analýze přežití |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Modely proporcionálních rizik |
Modely zrychleného času (Accelerated Failure Time, AFT) |
Literatura |
Coxův model proporcionálních rizik I |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Odhad regresních koeficientů Coxova modelu |
Testy o regresních koeficientech |
Breslowův odhad základní rizikové funkce |
Literatura |
Coxův model proporcionálních rizik II |
Výstupy z výukové jednotky |
Sestavení modelu |
Výběr vysvětlujících proměnných do modelu |
Stratifikovaný Coxův model |
Coxův model s časově závislou vysvětlující proměnnou |
Náhodné efekty v Coxově modelu |
Literatura |
Nástroje regresní diagnostiky |
Výstupy z výukové jednotky |
Úvod |
Rezidua modelu |
Ověření předpokladu proporcionality rizik |
Hodnocení vhodnosti modelu |
Literatura |
Modely s podílem vyléčených pacientů |
Další charakteristiky přežití
Výše definovaný popis pravděpodobnostního chování náhodné veličiny pomocí rizikové funkce, hustoty pravděpodobnosti a funkce přežití je sice úplný, ale trochu složitý a nepraktický. Často se tak kromě pravděpodobností přežití ve vybraných časových bodech používají pro popis pravděpodobnostního chování náhodné veličiny číselné charakteristiky, které shrnují vlastnosti rozdělení pravděpodobnosti veličiny do jednoho čísla, které je snadno interpretovatelné a lze s ním pracovat jednodušeji než s funkčním vyjádřením. Hlavními číselnými charakteristikami v analýze přežití jsou medián přežití a průměrná doba přežití.