Načítání a ukládání dat

Tyto výukové materiály předpokládají základní znalosti práce s daty v R, proto doporučujeme prostudovat si nejdříve výukovou jednotku Práce s daty , která je součástí výukových materiálů předmětu Výpočetní matematické systémy.

Načtení velkých datových souborů

Ne všechny soubory lze pohodlně a rychle načíst s pomocí základních R funkcí. Zejména načtení obrovských souborů (> 0.5 GB), jaké vznikají u mikročipových experimentů nebo experimentů sekvenačních, může načtení jednoho souboru trvat více než 15 hodin i na poměrně rychlích strojích (>4GB RAM).

V tomto případě doporučujeme instalaci knihovny data.table, která obsahuje funkci fread, naprogramovanou v C. Tato funkce dokáže načíst soubor o velikosti 1GB za méně než minutu a bez kompletního zablokování R.