Slovník | Vyhledávání | Mapa webu
 
Analýza genomických a proteomických datAnalýza sekvencí DNA Čtení fylogenetického stromu Počet možných stromů
Logo Matematická biologie

Počet možných stromů

Počet možných, plně rozlišených stromů, se rychle zvyšuje se zvyšujícím se počtem analyzovaných sekvencí (, Tab. 1).

Počet zakořeněných stromů:

 

přičemž v každém stromě je větví.

Celkový soubor možných stromů představuje krajinu stromů (tree space). Úlohou analytika je nalézt, který strom ze všech uvedených možností má nejvyšší věrohodnost (ML).

Tab. 1: Počet zakořeněných, plně rozlíšených stromů.
Počet sekvencí Spočet stromů

3
3
5 105
10 34 459 425
15
20
 
vytvořil Institut biostatistiky a analýz Lékařské fakulty Masarykovy univerzity